O Mάικ Λόουρι και ο Μάρκους Μπένετ, αστυνομικοί της δίωξης ναρκωτικών του Μαϊάμι, είναι επικεφαλής μιας ομάδας που προσπαθεί να εξιχνιάσει την υπόθεση διακίνησης χαπιών "έκσταση". Η έρευνα τους οδηγεί σε έναν άπληστο νονό, που επιδιώκοντας την αποκλειστικότητα του εμπορίου ναρκωτικών σε όλη την πόλη, έχει προκαλέσει εμφύλιο πόλεμο στον υπόκοσμο. Ταυτόχρονα, μια δυνατή ερωτική έλξη αναπτύσσεται ανάμεσα στον Μάικ και τη Σιντ, την αδελφή του Μάρκους...
Υποφέροντας από αμνησία, ο Μπορν έχει εγκαταλείψει το βίαιο παρελθόν του και ζει μια ήρεμη ζωή με την κοπέλα του, Μαρί. Τα σχέδιά του για μια ήρεμη ζωή ματαιώνονται όταν γλιτώνει παρά τρίχα από μια απόπειρα δολοφονίας. Τώρα, κυνηγημένος από έναν άγνωστο εχθρό, ο Μπορν αποδεικνύει ότι δεν είναι ούτε εύκολος στόχος, ούτε ένα άτομο του οποίου η ικανότητα, η αποφασιστικότητα και η ελαστικότητα μπορούν να υποτιμηθούν.
Ο Άαρον Κρος είναι μέλος της επιχείρησης Outcome, ένα από τα σκοτεινά προγράμματα του υπουργείου άμυνας. Σε αυτό, παρέχονται πράσινα χάπια που αυξάνουν τη φυσική δύναμη και μπλε που αυξάνουν τη νοητική. Ο Κρος μεταφέρεται στην Αλάσκα για εκπαιδευτική αποστολή κι εκεί γνωρίζει ένα άλλο μέλος της οργάνωσης, το Νούμερο 3. Την ίδια ώρα, οι αποκαλύψεις του Τζέισον Μπορν έχουν οδηγήσει σε έρευνα του FBI. Αποτέλεσμα είναι να παρθεί η απόφαση να καταργηθεί πλήρως η οργάνωση, ακόμα και να εξολοθρευτούν όσοι πράκτορες συμμετείχαν σε αυτήν. Στο στόχαστρο μπαίνει και καμπίνα που έχουν καταλύσει ο Κρος με τον 3. Ένα βλήμα θα την καταστρέψει, αλλά ο Κρος θα επιβιώσει, παρότι θεωρείται νεκρός.
