Supertähdet Martin Lawrence ja Will Smith ovat jälleen yhdessä kontrolloimattomina ja sekopäisinä superkyttinä. Bad Boys II on toimintaelokuva, joka sisältää elokuvahistorian villeimpiä takaa-ajoja. Luodit viuhahtelevat ja autot räjähtelevät kun huumekuninkaan takaa-ajo kulkee Miamin kaduilta kohti Kuuban gettoja. Jännitys ja toiminta tiivistyvät, kun Lawrence huomaa playboy-Smithin tapailevan salaa hänen seksikästä siskoaan.
Muistinmenetyksestä kärsivä Bourne on jättänyt väkivaltaisen menneisyyden taakseen ja elää tavallista elämää Marie-tyttöystävänsä kanssa. Suunnitelmat rauhallisesta elämästä romuttuvat, kun hän joutuu salamurhayrityksen kohteeksi. Tuntemattoman vihollisen jahtaama Bourne todistaa, ettei hän ole helppo kohde ja ettei hänen taitojaan ja sitkeyttään kannata aliarvioida.
Maahan saapuu olioita toisesta maailmasta. Tällä kertaa ne eivät ole suloisia eivätkä ystävällisiä! Nakertajat, karvaiset, piikkihampaiset otukset, kuuluisia tappavasta ruokahalustaan, ovat paenneet erittäin salaisesta vankilastaan läheisellä galaksilla. Ja ne ovat nälkäisiä! Kaksi hyväuskoista metsästäjää on palkattu valtaamaan nakertajien piilopaikan. Heidän viimeinen ohjeensa kuului: "Tappakaa ne ennen kuin ne syövät teidät". Mutta ennen kuin Kansasin asukkaat saavat sen tietoonsa, saattaa olla jo liian myöhäistä.
CIA:n sisällä toimii operaatio Threadstone, jonka tarkoituksena on tuottaa superagentteja valtion tarpeisiin. Ohjelmaan valitut yksilöt syövät päivittäin sinisiä ja vihreitä pillereitä, jotka lisäävät niin heidän psyykkisiä kuin fyysisiä kykyjään. Tieto operaatiosta on vuotanut talon ulkopuolelle ja ohjelma päätetään lopettaa. Jotta kukaan ei saisi tietää asiasta, tapetaan kaikki koulutuksessa mukana olleet. Geenimuunneltuja superagentteja ja heidän muokkaamiseensa osallistuneita tiedemiehiä aletaan murhata ympäri maailmaa. Yksi Outcomin agenteista, Aaron Cross, ei kuitenkaan pidä itsensä eliminoimisen ajatuksesta ja pakenee yhdessä häntä muokanneen lääkärin Stephanie Snyderin kanssa. Pakomatkalle he saavat peräänsä CIA:n tahtipuikoissa pyörivän Byerin, jonka pääasiallinen tehtävä on päästää Mr. Cross hengiltä.
Rutiinitehtävä päättyy räjähdykseen, joka vaikuttaa itsemurhayritykseltä. Tutkimuksissa ilmenee kuitenkin yllättäviä todisteita. Poliisi Martin Beck apulaisineen alkaa jäljittää huumeliigaa.
