Cabot is de ongeschreven meester in het organiseren van overvallen op juweliers. Zijn zoon 'Nice Guy' Eddie brengt een bende criminelen bij elkaar om een belangrijke diamantair te beroven. De zes weten niets van elkaar af en kennen slechts elkaars codenamen.
In de stad van Mitakihara, stuit Madoka Kaname, samen met haar vriendin Sayaka Miki, op een schepsel genaamd Kyubey en wordt van heksen gered door magical girl Mami Tomoe. Kyubey biedt Madoka en Sayaka de kans om een wens te vervullen in ruil voor het strijden tegen heksen als magical girls.
Wanneer de meiden te waarheid leren achter het bestaan van magical girls, valt de een na de ander weg. Ondanks dit alles, blijft één magical girl doorvechten - Homura Akemi.
She has a loving family and best friends, laughs and cries from time to time... Madoka Kaname, an eighth grader of Mitakihara middle school, is one of those who lives such a life. One day, she had a very magical encounter. She doesn't know if it happened by chance or by fate yet. This is a fateful encounter that can change her destiny. This is a beginning of the new story of the magical witch girls.
