Sam Flynn, de 27 jaar oude rebelse zoon van Kevin Flynn doet onderzoek naar de verdwijning van zijn vader, ooit bekend als ‘s werelds vooraanstaande gameontwikkelaar. Tijdens zijn zoektocht leidt een vreemd signaal, afkomstig van zijn vader, hem naar Flynns Arcade waar hij in de digitale wereld van Tron wordt getrokken.
Een hacker wordt in moleculen gespleten en een computer in getransporteerd. In deze computer heerst een programma genaamd Master Control als een dictator. De hacker gaat samenwerken met een boekhoudprogramma en zijn vriendin om Master Control te proberen te vervangen door Tron, een eerlijk systeem.
Filmproducent Viktor Taransky heeft een gigantisch probleem wanneer zijn ster-actrice plots opstapt. Computer-genie Hank Aleno helpt hem echter op bijzondere wijze uit de brand. Hij zorgt voor de ideale actrice: eentje die niet dik of oud wordt, eentje die niet zeurt en die bovendien geen ontslag kan nemen. Een virtuele, synthetische filmster is gecreëerd en haar naam is Simone.
Cybernetics engineer Fred Stiller uncovers a massive corporate conspiracy involving a virtual reality computer project.
